1-     توليد سريع شمار زيادي از گياهان كه از نظر ژنتيكي يكسان هستند

از اين روش براي گياهاني كه تكثير آن­ها از روشهاي مرسوم با مشكل مواجه مي باشند، مانند ژربرا، آنتوريوم، اركيد، سوسن، ارقام جديد رز و غيره استفاده مي­شود. گل ژربرا در رده اول تکثير کشت بافتي دنيا قرار دارد.

2-     حذف بيماريها و توليد گياهان عاري از بيماري

امروزه تمام شركت­هاي توليد كننده­ی گل در جهان از پايه هاي عاري از ويروس براي تكثير گل­ها بخصوص در مورد گل ميخك كه داراي ويروس­هاي اختصاصي زيادي است استفاده مي­كنند.

3-     توليد ارقام (ژنوتيپ­هاي­) جديد

در حال حاضر تنها در هلند هر ساله 125 رقم جديد داودي، 100 رقم ژربرا، 70 رقم ليليوم و 50 رقم ميخك توليد مي‌شود كه قسمتي از اين گياهان با كمك روش­هاي اصلاح از طریق كشت بافت بوجود آمده­اند.

مراحل تكثير:

چهار مرحله عمده فرايند تكثير درون شیشه­ای به شرح زیر است:

1-     تهيه كشت­هاي استريل (استقرار):اين مرحله اغلب به دليل آلودگي و توليد تركيبات فنوليك توسط ريز نمونه، مشكل است. با اين­حال در اين مرحله بايد تعداد مناسبي ريز نمونه بعد از ضد عفونی زنده مانده و برروي محيط كشت، بدون آلودگی رشد كنند.

2-     تولید و تكثير گیاهچه: عموماً افزودن هورمون­های سيتوكنين به محیط کشت، توليد شاخه از جوانه­هاي جانبي موجود و يا تولید شاخساره از برگ، ساقه، دمبرگ را به ميزان زيادي افزايش مي­دهد. جهت افزایش تولید گیاه در این مرحله مي­توان نمونه­ها را چندین مرتبه واكشت نمود.

3-     ريشه ­زايي در شرايط درون شيشه­اي: گیاهچه ­های حاصل از مرحله قبل به محیط ریشه­زایی حاوی اکسین منتقل می­شوند.

4-     سازگاری: گیاهچه ­هاي ريشه­ دار شده از محیط کشت خارج شده و آگار آن­ها به آرامي شسته مي­شود. اين گیاهچه ­ها جهت سازگاری به گلخانه­های با رطوبت بالا منتقل می ­شوند.